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 Les sources hydrothermales à l'origine du vivant ? Par Institut Méditerranéen d'Océanologie

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Les sources hydrothermales à l'origine du vivant ?  Par Institut Méditerranéen d'Océanologie Empty
MessageSujet: Les sources hydrothermales à l'origine du vivant ? Par Institut Méditerranéen d'Océanologie   Les sources hydrothermales à l'origine du vivant ?  Par Institut Méditerranéen d'Océanologie EmptyJeu 8 Jan - 21:12

Les sources hydrothermales à l'origine du vivant ?

En Nouvelle-Calédonie, le site hydrothermal de la baie de Prony, situé par moins de 50 m de profondeur près de Nouméa, est un formidable observatoire naturel qui permet de mieux comprendre les origines du vivant. On y trouve des bactéries capables d'utiliser le méthane et l'hydrogène dans un milieu alcalin, chaud mais pas trop. Les chercheurs commencent à isoler des espèces pour mieux comprendre cet écosystème extrême.


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La baie de Prony, dans le lagon sud de la Nouvelle-Calédonie. On y trouve un site exceptionnel, connu des plongeurs et protégé, où des « fumeurs noirs » émettent des fluides alcalins. Dans ce milieu très pauvre en oxygène prospère une flore bactérienne très particulière.
Des sources hydrothermales d’exception, connues depuis des dizaines d’années, sont étudiées depuis peu dans la baie de Prony, au sud de la Nouvelle-Calédonie. Cet écosystème marin sensible et très fragile a été reconnu par l’Union internationale pour la conservation de la nature (UICN) dans le cadre de l’inscription au patrimoine mondial des récifs et lagons de Nouvelle-Calédonie. En 2011, la campagne océanographique Hydroprony a été lancée, financée par l’Institut de recherche pour le développement (IRD) et une équipe de scientifiques issus de différents laboratoires français (IRD Nouméa, Institut Méditerranéen d’Océanologie (MIO), Geosciences Environment Toulouse et Institut de Physique du Globe de Paris). Cela a permis de débuter un vaste projet visant à étudier l’ensemble du système hydrothermal de Prony de manière multidisciplinaire en associant la géochimie, la minéralogie et la biologie.
Contrairement aux sources hydrothermales, plus connues sous le nom de « fumeurs noirs » et qui émettent des fluides chauds (avoisinant 350 °C) et acides (pH faible inférieur à 3) au niveau des dorsales océaniques, les sources sous-marines de Prony, situées à moins de 50 m de profondeur dans le lagon, libèrent des fluides alcalins (pH élevé supérieur à 11) très peu salés avec des températures plus modérées (inférieures à 40 °C). (Voir l'article publié dans Geoscience.)

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Ces cheminées hydrothermales du massif dit l’Aiguille de Prony, sont situées à 20 m de profondeur. Le site est protégé par arrêté de la province sud pour sa valeur patrimoniale. Les  structures sont formées de carbonates et d’hydroxydes de magnésium qui émettent un fluide alcalin (pH supérieur à 11) anoxique et riche en hydrogène et en méthane.

Des fluides alcalins, du CO2 et de l'hydrogène : une recette pour l'origine de la vie ?

Ces fluides précipitent au contact de l’eau de mer et forment des cheminées carbonatées pouvant atteindre plusieurs mètres de haut. L'exemple emblématique, une merveille naturelle, est l'Aiguille de Prony, un site privilégié des plongeurs sous-marins. Ce type d’hydrothermalisme original n’avait été observé et étudié qu’à Lost City, découvert en 2000 à 800 m de profondeur à proximité de la dorsale medio-atlantique par des équipes américaines. À Prony, comme à Lost City, les fluides alcalins sont anoxiques (pauvres en oxygène) et contiennent des quantités élevées d’hydrogène produit lors de l'hydratation des roches du manteau terrestre : un processus abiotique dénommé « serpentinisation ». L’hydrogène produit réagit ensuite avec le dioxyde de carbone (gaz carbonique) environnant pour générer du méthane et d’autres molécules organiques comme les alcanes.
Depuis une dizaine d’années, les sources hydrothermales alcalines suscitent un intérêt croissant de la part de la communauté scientifique car leur contexte géochimique particulier aurait pu être favorable à l’émergence de la vie sur la Terre primitive il y a quelque 3 milliards d’années et potentiellement sur d’autres planètes telles que Mars. Le site de Prony, idéalement situé à faible profondeur, à la transition entre les compartiments terrestres et marins, constitue donc un observatoire naturel facilement accessible pour mieux comprendre les processus biotiques et abiotiques qui auraient pu conduire à la première cellule vivante.

Les micro-organismes vivent en abondance au cœur des cheminées hydrothermales en contact direct avec les fluides alcalins et les carbonates, allant jusqu’à former d’importants biofilms. Plus d’une centaine despèces ont déjà été répertoriées à l’aide d’approches moléculaires basées sur le séquençage de gènes marqueurs. Notre récente étude (publiée dans Environmental Microbiology Reports) révèle également que leur abondance et leur diversité varient en fonction de la profondeur, de la localisation et de la structure des cheminées.

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Petites cheminées carbonatées sur le platier rocheux du Bain des Japonais émettant des bulles de gaz (H2, CH4, N2) et du fluide à pH 11 et 42 °C. Barre d’échelle, 10 cm.

Des bactéries alcalophiles consommatrices de méthane enfin étudiées de près !

Actuellement, il s'agit de rechercher les principaux groupes trophiques microbiens, qui sont en liaison directe avec la géochimie de ces écosystèmes (production d’hydrogène et méthane notamment), pour mieux appréhender les mécanismes d’adaptation en condition extrême (pH alcalin) et leur rôle dans l’édification des cheminées. Des capteurs sont actuellement en place sur trois sources de la baie de Prony pour mesurer à long terme la température des fluides émis par les cheminées et il est également prévu d’y placer des incubateurs in situ pour identifier les processus de colonisation microbienne de ces cheminées au cours du temps.

Au cœur des cheminées, les micro-organismes n’ont accès qu’à des niveaux très faibles d’oxygène et de lumière et l’on peut supposer qu’ils manifestent essentiellement un métabolisme anaérobie (c'est-à-dire en l'absence d’oxygène) basé sur l’utilisation et la production de l’hydrogène et du méthane. Nous tentons de reproduire en laboratoire les conditions favorables au développement des micro-organismes indigènes. Plusieurs bactéries alcalophiles (donc ayant, par définition, un pH optimum de croissance entre 8 et 11,5) ont déjà été isolées de ces sources par les chercheurs de notre équipe. Parmi elles, on notera l’isolement de la première bactérie alcalophile associée aux fluides alcalins de Prony, Alkaliphilus hydrothermalis.

Comme pour la plupart des écosystèmes étudiés sur terre, la majorité des micro-organismes détectés sur ce site reste encore incultivée, ce qui augure des découvertes originales à faire par les microbiologistes de l’IRD et d’autres institutions françaises travaillant sur cet écosystème extrême. L’isolement de micro-organismes utilisant le méthane en absence d’oxygène constitue un défi majeur pour l'équipe, mais également pour la communauté scientifique internationale, dans la mesure où ces organismes pourraient être les premiers colonisateurs de la Terre primitive.

Cet article a été rédigé par Marianne Quéméneur, Anne Postec et Gaël Erauso (MIO UMR 7294 Aix-Marseille Université, CNRS, IRD, Université de Toulon au sein de l'OSU Pythéas).

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Les sources hydrothermales à l'origine du vivant ? Par Institut Méditerranéen d'Océanologie
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